| Méthode analytique utilisée | Extraction ARN, RT-PCR, RQ-PCR.
RT-MLPA : Recherche des réarrangements récurrents des hémopathies malignes impliquant les gènes ABL1, ABL2, AFF1, AFF3, AFF4, ARHGAP26, ARHGEF12, ARHGEF17, ARNT, ATF7IP, BCR, BMP2K, C2CD3, CBFA2T3, CBFB, CBL, CCDC6, CHIC2, CIP2A, CNTRL, CREBBP, CRLF2, CSF1R, CUX1, DCPS, DDX10, DEK, EBF1, ELL, EML1, EP300, EPS15, ETV6, FGFR1, FGFR1OP, FIP1L1, FLT3, FOXO3, FOXP1, GATA1, GLIS2, HLF, HOXA9, INPP5D, JAK2, KAT6A, KDM5A, KMT2A, KNL1, LYN, MAML2, MAPRE1, MEF2D, MLF1, MLLT1, MLLT10, MLLT11, MLLT3, MLLT6, MN1, MNX1, MRTFA, MYB, MYH11, NCOR1, NDE1, NPM1, NRIP3, NSD1, NTRK3, NUP214, NUP98, OFD1, P2RY8, PAG1, PAX5, PBX1, PCM1, PDE4DIP, PDGFRA, PDGFRB, PICALM, PML, RANBP2, RAP1GDS1, RARA, RBM15, RCSD1, RUNX1, RUNX1T1, SEPTIN5, SEPTIN6, SEPTIN9, SET, SFPQ, SNX2, SPAG9, SPTBN1, SSBP2, STAT5B, STIL, STRN, STRN3, TAF15, TAL1, TCF3, TERF2, TET1, TOP1, TPM3, TPR, TRIM24, ZBTB16, ZC3HAV1, ZEB2, ZMIZ1, ZMYM2 et ZNF384, y compris BCR-ABL1, équivalent moléculaire de la translocation t(922).
A noter que cette technique ne détecte que les points de cassure introniques, ne permettant pas la détection des très rares points de cassure exoniques (FIP1L1-PDGFRA, PML-RARA de type bcr2). |